南通机动车违章查询的方式有多种，包括：

1. 官方网站查询：可以搜索南通市公安局交通警察支队的官网，找到“网上服务大厅”，再找到“机动车违法查询”，输入车辆的相关信息，即可查询。

2. 微信公众号查询：可以搜索并关注南通交警的公众号，在公众号中找到“信息查询”，然后按照提示输入相关信息即可。

3. APP查询：下载并安装南通交警APP，输入车辆信息等相关数据，即可查询。

4. 线下查询：车主可以携带身份证、驾驶证和行驶证等证件的原件或复印件，前往南通交警大队或车管所的违法处理窗口进行查询。

以上方式仅供参考，建议访问南通市公安局交警支队的官方网站以获取最准确的信息。此外，违章查询的开放时间和具体流程可能会根据实际情况进行调整，如需了解更多信息，建议联系当地的交警部门或咨询其工作人员。